Ba tuần sau phiên điều trần, văn bản thoả thuận chính thức cuối cùng cũng được hoàn thiện, sau nhiều vòng đàm phán chi tiết giữa các luật sư của cả hai bên, với sự giám sát của hội đồng độc lập.

Theo thoả thuận, toàn bộ hiện vật khảo cổ khai quật trực tiếp từ xác tàu Bãi Chướng, bao gồm mảnh lụa dệt chỉ vàng, các món trang sức, ấn tín, và di cốt, thuộc quyền sở hữu hoàn toàn của nhà nước, được lưu giữ và trưng bày tại Bảo tàng Quảng Nam. Đây là phần lớn nhất và có giá trị nhất trong toàn bộ câu chuyện, và bà Kim Ngọc không có bất kỳ quyền can thiệp nào vào các quyết định liên quan tới chúng.

Cuốn sổ gia phả, dù được số hoá đầy đủ và lưu bản sao tại Bảo tàng theo đúng yêu cầu, vẫn giữ nguyên quyền sở hữu danh nghĩa thuộc về gia đình bà Kim Ngọc, với điều kiện bảo quản định kỳ được kiểm tra bởi chuyên gia độc lập mỗi năm một lần.